Sekce zprostředkuje prostorové informace z oblasti ochrany přírody a životního prostředí. Jedná se zejména o zvláště chráněná území (vektorizace zvláště chráněných území v kompetenci JMK nad podkladem vektorové katastrální mapy), území soustavy NATURA 2000, obecnou ochranu krajiny, ochranná pásma vodních zdrojů a záplavová území.
Informace z činnosti odboru životního prostředí JMK naleznete zde.